Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms