Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms