Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4BQ9NPR2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms