Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms