Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms