Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms