Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms