Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB1BQ9H0U4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms