Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms