Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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KRTAP4-3Q9BYR4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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KRTAP4-3Q9BYR4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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KRTAP4-3Q9BYR4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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KRTAP4-3Q9BYR4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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KRTAP4-3Q9BYR4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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KRTAP4-3Q9BYR4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP4-3Q9BYR4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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