Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms