Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A5Q9BY07 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms