Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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