Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSF3RQ99062 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CSF3RQ99062 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms