Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC22A12Q96S37 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC22A12Q96S37 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms