Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMTK3Q96Q04 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms