Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms