Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms