Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CABS1Q96KC9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms