Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms