Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms