Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms