Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms