Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPTQ96BT3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms