Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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