Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR2Q969E8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms