Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms