Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX33Q8WV41 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms