Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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