Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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