Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC4Q8TBB5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms