Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms