Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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