Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms