Protein–RNA interactions for Protein: Q86VZ4

LRP11, Low-density lipoprotein receptor-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP11Q86VZ4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.06
LRP11Q86VZ4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms