Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms