Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF493Q6ZR52 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF493Q6ZR52 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms