Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM72Q6ZMU5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms