Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG3Q6UXM1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms