Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms