Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP4R4Q6NUP7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP4R4Q6NUP7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms