Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms