Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms