Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD4Q5VX71 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms