Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC181Q5TID7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms