Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms