Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFNL1Q499Z3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms