Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00303Q3SY05 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms