Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms