Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms